Генетические полиморфизмы генов HNF1B, CASC17, CASC8 И CCAT2, ассоциированных с риском развития рака простаты, у пациентов урологического профиля
Цель исследования. Провести сравнительный анализ комбинаций аллельных вариантов SNP rs4430796 (HNF1B), rs1859962 (CASC17), rs1447295 (CASC8) и rs6983267 (CCAT2) у пациентов урологического профиля.Полуконова Н.В., Фомкин Р.Н., Пылаев Т.Е., Бучарская А.Б., Мезиров Г.Г., Воронина Е.С., Попков В.М., Фомкина О.А., Крупинов Г.Е.
Материалы и методы. Проведено генетическое исследование крови 236 пациентов российской популяции, среди которых 97 – с доброкачественной гиперплазией простаты (ДГП), 89 – с раком простаты (РП) и 50 – с мочекаменной болезнью (МКБ) – группа контроля. Выделение ДНК проводили из венозной крови, генотипирование – методом ПЦР с последующей рестрикционной деградацией. Частоты аллелей и генотипов сравнивали между группами с использованием χ²-критерия. Оценивали отношение шансов (OR) и 95% доверительные интервалы.
Результаты. Установлена ассоциация мутантных аллелей T (HNF1B) и C (CASC17) при РП и ДГП, отсутствующая в группе контроля. Генотип ТТ по rs4430796 (HNF1B) ассоциирован с повышенным риском опухоли простаты (OR=2,38; 95% CI: 1,26–4,47; p=0,004). Генотип СС по rs1859962 (CASC17) также ассоциирован с опухолью простаты (OR=3,80; 95% CI: 1,30–11,4; p=0,015). Комбинация ТТ (HNF1B) + СС (CASC17) отсутствовала у пациентов с МКБ, но часто встречалась у пациентов с РП и ДГП также рассматривается как возможный маркер опухолевого процесса. Площадь под кривой (AUC) составила 0,71, что соответствует умеренной диагностической ценности. Геномные комбинации GG TT (CASC8+CCAT2) и GG G/T различались между группами ДГП и РП. Выявлены уникальные комбинации по четырем SNP, характерные для пациентов с ДГП.
Заключение. Комбинированный анализ полиморфизмов rs4430796 и rs1859962 может служить основой для генетической стратификации риска РП в российской популяции. Выявленные геномные комбинации обладают потенциалом в качестве маркерных панелей для скрининга и дифференциации РП и ДГП, а также для развития персонализированных подходов в онкоурологии.
Ключевые слова
рак простаты
доброкачественная гиперплазия простаты
ген HNF1B
ген CASC17
ген CASC8
ген CCAT2
генетическая стратификация риска
Список литературы
1. Kaprin A.D., Starinskiy V.V., Shakhzadova A.O. et al. Malignant neoplasms in Russia in 2023 (incidence and mortality). Moscow: MNIIO P.A. Herzen (branch of Federal State Budgetary Institution «National Medical Research Center of Radiology» of the Ministry of Health of the Russian Federation); 2024. 276 p. Russian (Каприн А.Д., Старинский В.В., Шахзадова А.О. Злокачественные новообразования в России в 2023 г. (заболеваемость и смертность). Москва: МНИОИ им. П.А. Герцена (филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Минздрава России), 2024. 276 с.). ISBN 978-5-85502-298-8.
2. Somov A.N., Suslin S.A. Prostate cancer: epidemiology, modern trends in diagnostics and risk stratification. Russian Journal of Preventive Medicine. 2020;23(3):149–155. doi:10.17116/profmed202023031149. Russian (Сомов А.Н., Суслин С.А. Рак предстательной железы: эпидемиология, современные тенденции диагностики и стратификация групп риска. Российский журнал профилактической медицины. 2020;23(3):149–155).
3. Kaprin A.D., Alekseev B.Ya., Matveev V.B. et al. Prostate cancer. Clinical guidelines. Sovremennaya onkologiya. 2021;23(2):211–247. doi:10.26442/18151434.2021.2.200959. Russian (Каприн А.Д., Алексеев Б.Я., Матвеев В.Б. и др. Рак предстательной железы. Клинические рекомендации. Современная онкология. 2021;23(2):211–247).
4. Mucci L.A., Hjelmborg J.B., Harris J.R. et al. Familial risk and heritability of cancer among twins in Nordic countries. JAMA. 2016;315(1):68–76. doi:10.1001/jama.2015.17703.
5. Allemailem K.S., Almatroudi A., Alrumaihi F., Almansour N.M., Aldakheel F.M., Rather R.A., Afroze D., Rah B. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in prostate cancer: implications in diagnostics and therapeutics. American Journal of Translational Research. 2021;13:3868–3889.
6. Vieira G.M., Gellen L.P.A., da Veiga Borges Leal D.F., Pastana L.F., Vinagre L.W.M.S., Aquino V.T., Fernandes M.R., de Assumpção P.P., Burbano R.M.R., Dos Santos S.E.B., Dos Santos N.P.C. Correlation between genomic variants and worldwide epidemiology of prostate cancer. Genes (Basel). 2022;13(6):1039. doi:10.3390/genes13061039.
7. Polukonova N.V., Fomkin R.N., Demin A.G., Pylaev T.E., Mezirov G.G., Mudrak D.A., Bucharskaya A.B., Voronina E.S., Maslyakova G.N., Popkov V.M. Molecular markers and their combinations for prediction of prostate cancer risk. In: Proceedings of XI International Scientific and Practical Conference «Molecular Diagnostics». Moscow; 2023. p. 203. Russian (Полуконова Н.В., Фомкин Р.Н., Демин А.Г., Пылаев Т.Е., Мезиров Г.Г., Мудрак Д.А., Бучарская А.Б., Воронина Е.С., Маслякова Г.Н., Попков В.М. Молекулярные маркеры и их комбинации для прогнозирования риска развития рака предстательной железы. Молекулярная диагностика. Сборник трудов XI Международной научно-практической конференции. Москва; 2023. С. 203).
8. Mylnikov A.M., Demin A.G., Polukonova N.V., Bucharskaya A.B., Fomkin R.N., Pylaev T.E., Ponukalin A.N. Method for predicting risk of prostate cancer development. Patent for invention RU 2827104 C1, 2024 Sep 23. Application No. 2023134769, 2023 Dec 22. Russian (Мыльников А.М., Демин А.Г., Полуконова Н.В., Бучарская А.Б., Фомкин Р.Н., Пылаев Т.Е., Понукалин А.Н. Способ прогнозирования риска развития рака предстательной железы. Патент на изобретение № 2827104 С1, 23.09.2024. Заявка № 2023134769 от 22.12.2023).
9. Ren F., Wang M., Wu Z. et al. Association of rs1859962 (17q24) with prostate cancer risk: meta-analysis. Medicine (Baltimore). 2020;99(3):e18398. doi:10.1097/MD.0000000000018398.
10. Zhao Y., Shen C., Guo M. et al. Cumulative evidence for relationships between 8q24 variants and prostate cancer. Frontiers in Physiology. 2018;9:915. doi:10.3389/fphys.2018.00915.
11. Schumacher F.R., Olama A.A., Berndt S.I. et al. Association analysis of more than 140,000 men identifies 63 new prostate cancer susceptibility loci. Nature Genetics. 2018;50(7):928–936. doi:10.1038/s41588-018-0142-8.
12. Zhao Y., Wang X., Ni Y., Ma Y., Peng X. Meta-analysis of the HNF1B rs4430796 polymorphism and prostate cancer risk. Genetics and Molecular Research. 2015;14(3):7426–7435.
13. Ren F., Zhang Y., Zhang W., Zeng W., Xu Q., Wang Y., Liu Z. Association of rs1859962 (17q24) with prostate cancer risk: meta-analysis. Medicine (Baltimore). 2020;99(3):e18398. doi:10.1097/MD.0000000000018398.
14. Zhao Y., Zhang L., Shen C. et al. Can long-term regular practice of physical exercises including Tai Chi improve finger tapping of patients presenting with mild cognitive impairment? Frontiers in Physiology. 2018;9:1396. doi:10.3389/fphys.2018.01396.
15. Seibert T.M., Fan C.C., Wang Y. et al. Polygenic hazard score for aggressive prostate cancer. BMJ. 2018;360:j5757. doi:10.1136/bmj.j5757.
Об авторах / Для корреспонденции
А в т о р д л я с в я з и: Р.Н. Фомкин – к.м.н., доцент, доцент кафедры урологии, старший научный сотрудник, ФГБОУ ВО «Саратовский ГМУ им. В.И. Разумовского» Минздрава России, НИИ фундаментальной и клинической уронефрологии, Саратов, Россия; е-mail: rnfomkin@mail.ruТакже по теме
