ISSN 1728-2985
ISSN 2414-9020 Online

Исследование роли полиморфных локусов RS2299941, RS1903858, RS10490920, RS2735343 гена PTEN у пациентов с раком простаты

В.Н. Павлов, М.В. Логинова, Е.А. Иванова, А.Т. Мустафин, И.Р. Гилязова

1) ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет», Клиника БГМУ Минздрава России, Республика Башкортостан, Уфа, Россия; 2) ФГБУН «Институт биохимии и генетики» Уфимского федерального исследовательского центра РАН; Республика Башкортостан, Уфа, Россия
Введение. Рак простаты является клинически гетерогенным заболеванием, и точная стратификация риска пациентов становится ключевой клинической задачей. Это наиболее частое встречающееся злокачественное новообразование и ведущая причина смерти от рака среди мужчин в мире. Геномные маркеры включают инструменты и технологии, способные предсказывать вероятность первоначальной положительной биопсии, уменьшать количество ненужных повторных биопсий, выделять опухоли с низким, средним и высоким рисками, классифицировать степень заболевания, а также прогнозировать и контролировать клинический ответ на вмешательство. Варианты гена PTEN представляют большой интерес в качестве генетических маркеров риска развития злокачественных новообразований простаты.
Цель исследования – оценка роли полиморфных локусов rs2299941, rs1903858, rs10490920,rs2735343 гена PTENу пациентов с раком простаты в качестве возможных молекулярно-генетических маркеров риска развития заболевания.
Материалы и методы. Нами была сформирована группа пациентов с раком простаты, включившая 457 человек, и группа здоровых доноров, проживающих в Республике Башкортостан, которая по возрасту, этнической принадлежности, территории проживания и численности соответствовала группе больных. ДНК индивидов обеих групп выделена из периферической венозной крови методом фенольно-хлороформной экстракции. При анализе частот распределения генотипов и аллелей учитывались возраст, стадия по классификации TNM, степень дифференцировки по шкале Глисона. Идентификация генотипов и аллелей изученного полиморфного локуса проводилась с использованием метода аллельной дискриминации TaqMan.
Результаты и обсуждение. Проведено исследование влияния полиморфных вариантов rs2299941, rs1903858, rs10490920,rs2735343 гена PTENна риск развития РП. Установлено, что полиморфный вариант rs2735343 гена PTEN служит маркером риска развития заболевания и его тяжелого течения для жителей Республики Башкортостан.
Заключение. Полученные результаты исследования предполагают, что изменения в гене PTEN способны предсказывать риск развития РП, а также агрессивное течение заболевания.

Ключевые слова

рак простаты
ген PTEN
однонуклеотидные полиморфизмы
ПСА

Введение. Рак простаты (РП) является гетерогенным и многофакторным заболеванием, которое протекает в виде вялых или крайне агрессивных опухолей и является значимым источником заболеваемости и смертности среди мужского населения. В 2018 г., по оценкам, зарегистрировано 1,3 млн новых случаев и 359 тыс. связанных с ними смертей во всем мире [1, 2].

Простатспецифический антиген (ПСА) является наиболее часто используемым скрининговым биомаркером для диагностики РП и мониторинга развития злокачественного процесса. Однако использование тестирования на ПСА при скрининге РП вызывает споры из-за отсутствия окончательных данных рандомизированных исследований и отсутствия специфичности между доброкачественными и злокачественными новообразованиями. Стратификация на основе традиционных клинических параметров может определять риск развития у пациентов злокачественных новообразований, вероятность прогрессирования рака на ранней стадии заболевания [3].

Наиболее часто используемыми методами прогнозирования РП является классификация TNM, используемая с градацией по шкале Глисона, и определение уровня ПСА [4]. Однако клиническое применение этих показателей ограниченно. Американская урологическая ассоциация поощряет выявление новых генетических маркеров, которые помогут идентифицировать мужчин с повышенным риском развития и прогрессирования заболевания [5].

В исследованиях все чаще выявляется связь однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) с развитием различных заболеваний, в результате чего SNP постепенно используются в качестве маркеров, связанных с раком, в том числе и с РП. Следовательно, SNP привлекают значительное внимание для использования их в качестве прогностических показателей до и после лечения пациентов с РП [6].

За последние десятилетия различные SNP связывают с развитием аденокарциномы простаты. SNP гена PTEN представляют значительный интерес в качестве генетического маркера риска развития злокачественных новообразований простаты.

Ген PTEN представляет собой супрессор опухоли с двойной специфичностью, основным субстратом которого является фосфатидилинозитол(3,4,5)-трисфосфат (PIP3). Белок PTEN действует как антагонист на пути PI3K/AKT, поддерживая низкий уровень PIP3: чем больше концентрация PIP3, тем сильнее сигнализация пути PI3K/AKT, которая провоцирует ингибирование клеточного цикла, миграцию, метастазирование и апоптоз. Вероятность потери функции гена PTEN выше при агрессивном метастатическом заболевании, что предполагает возможность его применения в качестве генетического маркера для прогнозирования течения заболевания и для отличия вялотекущих опухолей от агрессивных форм рака [7, 8, 19].

Среди прогностических биомаркеров ДНК, полученных в результате секвенирования тысяч случаев РП, потеря гена PTEN, возможно, остается одной из наиболее многообещающих [9]. Инактивация PTEN при опухолях простаты связана с неблагоприятными онкологическими исходами, такими как увеличение степени дифференцировки и распространенности онкологического процесса, более ранним биохимическим рецидивом после радикальной простатэктомии, метастазированием, смертью от РП и андроген-независимым прогрессированием заболевания [10–12]. В ранее проведенных исследованиях подтверждена корреляция делеции гена PTEN с увеличением балла Глисона и повышением вероятности экстрапростатического расширения у пациентов с локализованным РП, получивших хирургическое лечение [13]. В нескольких крупных исследованиях подтверждена связь потери PTEN с повышенным риском биохимического рецидива после простатэктомии [10, 14, 15]. Возможно, самое важное, что PTEN оказался независимым прогностическим показателем смерти от РП у пациентов, получавших консервативное или хирургическое лечение [16, 17]. В одном небольшом исследовании потеря PTEN в образце биопсии предсказала повышенный риск кастрационно-резистентного РП, метастазирования и смертности среди пациентов, получавших хирургическое лечение [18].

Принимая во внимание связь между потерей PTEN и увеличением балла Глисона, ген PTEN может быть полезным в качестве прогностического маркера при локализованном РП. Широкое внедрение новых генетических маркеров позволит обнаружить различные заболевания до появления клинических проявлений, тем самым позволит предоставлять дополнительную и независимую информацию о возможных рисках, клиническом течении, прогнозе и предполагаемом исходе.

Цель исследования – оценка роли полиморфных локусов rs2299941, rs1903858, rs10490920,rs2735343 гена PTEN у пациентов с раком простаты в качестве возможных молекулярно-генетических маркеров риска развития заболевания.

Материалы и методы. Характеристика выборки. В исследование включены 457 пациентов с подтвержденным гистологическим диагнозом РП и 474 здоровых индивида без РП. Все обследованные были пациентами клиники Башкирского государственного медицинского университета, Уфа. Забор образцов крови проводился сотрудниками кафедры урологии. Пациенты и контрольные группы были добровольцами, и письменное информированное согласие получено от каждого участника, ответившего на вопросник. Исследование одобрено биоэтическим комитетом Института биохимии и генетики УФИЦ РАН. В исследуемой группе 33,4% пациентов имели начальные стадии заболевания (I–II стадии злокачественного процесса, согласно TNM классификации) и 66,6% пациентов – поздние стадии (III–IV стадии злокачественного процесса, согласно классификации TNM). Степень дифференцировки опухоли простаты проводилась по шкале Глисона. Сумма баллов по Глисону менее 8 баллов – 80,8% пациентов, более 8 – 19,25%. Возраст пациентов варьировался от 44 до 89 лет.

Выделение геномной ДНК. При выполнении молекулярногенетического исследования использовались образцы ДНК из лимфоцитов периферической венозной крови. Крoвь набирали в вакуумные пробирки с К3 ЭДТА (этилендиаминтетрауксусная кислота) в качестве антикoагулянта. Выделение ДНК проводили методом последовательной фенольно-хлороформной экстракции по Мэтью.

Генотипирование. В гене PTEN проведено генотипирование четырех SNP, выбранных из общедоступной базы данных одиночных нуклеотидов (rs2299941, rs1903858, rs10490920, rs2735343). Идентификация генотипов и аллелей изученных полиморфных локусов гена PTEN проводилась с использованием метода аллельной дискриминации TaqMan. Статистическая обработка полученных результатов проводилась с использованием таблицы сопряженности 2х2 (http://www.biometrica.tomsk.ru/freq_ New.htm).

Результаты и обсуждение. Проведенный нами анализ полиморфного локуса rs2735343 гена PTEN позволил выявить генотипы, ассоциированные с риском развития РП. При разделении больных по возрасту манифестации РП в группе больных с возрастом начала заболевания после 55 лет выявлено более частое носительство генотипа rs2735343*CG гена PTEN по сравнению с контрольной группой (42 и 21% соответственно) (p=0,009, OR=2,81, CI=1,25–6,30). Сравнительный анализ выборки больных РП с контрольной группой показал, что у пациентов с поздними стадиями заболевания статистически значимо чаще встречается генотип rs2735343*CG гена PTEN по сравнению с контрольной выборкой; данный генотип является рисковым в отношении развития РП тяжелого течения у жителей Республики Башкортостан (p=0,002, OR=2,05, 52% CI=1,31–3,22), в то время как генотип rs2735343*GG протективный в отношении развития заболевания тяжелого течения (p=0,004, OR=0,51, 52% CI=0,32–0,81). При сравнении частот генотипов изученного локуса гена PTEN в анализируемых нами группах с учетом градации по шкале Глисона выявлено, что носительство генотипа rs2735343*CG гена PTEN (p=0,02, OR=0,48, 38% CI=0,27–0,87) может быть протективным маркером в отношении развития РП, тогда как носительство гомозиготного генотипа rs2735343*GG гена PTEN (p=0,005, OR=2,44, 55% CI=1,33–4,46) – маркер риска развития заболевания. Распределение частот генотипов полиморфного локуса rs2735343 гена PTEN представлено в табл. 1.

61-1.jpg (201 KB)

Сравнительный анализ полиморфных локусов rs2299941, rs1903858, rs10490920 гена PTEN между группами больных РП и здоровых доноров из Республики Башкортостан статистически значимых различий не выявил. Частоты генотипов приведены в табл. 2.

61-2.jpg (194 KB)

С учетом важной роли, которую SNP играют в качестве генетических маркеров при различных типах заболеваний, выбран ген PTEN и SNP, которые являются кандидатами на восприимчивость к РП и влиянию на прогноз заболевания [20]. Компоненты сигнального пути PTEN/PI3K/AKT являются важным регулятором роста, метаболизма, клеточного цикла, репарации ДНК и ингибирования апоптоза [21]. Изученный здесь полиморфный вариант rs2735343 расположен в интронной области гена PTEN. Согласно Jang et al., он может влиять на сплайсинг, экспрессию белка, следовательно, регуляцию клеточного цикла и риск развития рака [22].

Наши результаты, добавленные к этим, предполагают, что определенные изменения в этом гене способны предсказывать риск развития РП, а также агрессивное течение заболевания.

Выводы. Данные, полученные в нашем исследовании, расширяют знания о генетических основах предрасположенности к РП. Идентификация и внедрение новых маркеров позволят улучшить прогнозирование поведения опухоли у пациентов с РП. Понятие о молекулярно-генетических маркерах предоставит возможность лечащему врачу индивидуализировать лечение в соответствии с генетическими характеристиками каждого пациента. Результаты нашего исследования указывают на возможную роль SNP rs2735343 гена PTEN как потенциального молекулярного маркера, использование которого возможно в комплексных прогностических панелях для диагностики РП, однако полученные данные нуждаются в дополнительном подтверждении перед применением в клинической практике. Тем не менее необходимо проводить дальнейшие исследования полиморфного локуса rs2735343 гена PTEN для установления функциональной значимости и роли в патогенезе рака простаты.

Список литературы

1. Saini S. PSA and beyond: Alternative prostate cancer biomarkers. Cell Oncol. 2016;39:97–106. Doi: 10.1007/s13402-016-0268-6.

2. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I., Siegel R.L., Torre L.A., JemalA. Global Cancer Statistics 2018: GLOBOCAN estimatesof incidence and mortality worldwide for 36 cancersin 185 countries. CA Cancer J Clin. 2018; 68:394–424. Doi: 10.3322/caac.21492.

3. Brajtbord J.S., Leapman M.S., Cooperberg M.R. The CAPRA score at 10 years: contemporary perspectives and analysis of supporting studies. Eur Urol. 2017;71:705–709. Doi: 10.1016/j.eururo.2016.08.065.

4. Buyyounouski M.K., Choyke P.L., McKenney J.K., Sartor O., Sandler H.M., Amin M.B., Kattan M.W., Lin D.W. Prostate cancer - major changes in the American Joint Committee on Cancer eighth edition cancer staging manual. CA Cancer J Clin. 2017; 67:245–253. Doi: 10.3322/caac.21391.

5. Carter H.B., Albertsen P.C., Barry M.J., Etzioni R., FreedlandS.J.,GreeneK.L., Holmberg L., Kantoff P., Konety B.R., MuradM.H.et al. Early detection of prostate cancer: AUA Guideline. J Urol. 2013; 190:419–426. Doi: 10.1016/j.juro.2013.04.119.

6. Qi X., Wang Y., Hou J., Huang Y. A single nucleotide polymorphism in HPGD gene is associated with prostate cancer risk. J Cancer. 2017; 8:4083–4086. Doi: 10.7150/jca.22025.

7. Gu X., Zhou L., Lei Chen L., Huiqing Pan H., ZhaoR., GuangW. et al. Human Schlafen 5 Inhibits Proliferation and Promotes Apoptosis in Lung Adenocarcinoma via the PTEN/PI3K/AKT/mTOR Pathway. Biomed Res Int. 2021:6628682. Doi: 10.1155/2021/6628682.

8. Wise H.M., Hermida M.A., Leslie N.R. Prostate cancer, PI3K, PTEN and prognosis. Clin Sci. 2017; 131:197–210.Doi: 10.1042/CS20160026.

9. Yoshimoto M., CunhaI. W., Coudry R. A., Fonseca F.P., Torres C.H., Soares F.A., Squire J.A. FISH analysis of 107 prostate cancers shows that PTEN genomic deletion is associated with poor clinical outcome. Br J Cancer. 2007; 97:678–685. Doi: 10.1038/sj.bjc.6603924.

10. Troyer D.A., Jamaspishvili T., Wei W., Feng Z., Good J. et al. A multicenter study shows PTEN deletion is strongly associated with seminal vesicle involvement and extracapsular extension in localized prostate cancer. Prostate. 2015;75:1206–1215. Doi: 10.1002/pros.23003.

11. Yoshimoto M., Cutz J., Nuin P., Joshua A., Bayani J., Evans A., Zielenska M., Squire J. Interphase FISH analysis of PTEN in histologic sections shows genomic deletions in 68% of primary prostate cancer and 23% of high-grade prostatic intra-epithelial neoplasias. Cancer Genet Cytogenet. 2006;169:128–137. Doi: 10.1016/j.cancergencyto.2006.04.003.

12. Sircar K., Yoshimoto M., Monzon F., Koumakpayi I., Katz R. PTEN genomic deletion is associated with p-Akt and AR signalling in poorer outcome, hormone refractory prostate cancer. J Pathol. 2009; 218:505–513. Doi: 10.1002/path.2559.

13. Wang Y., Dai B. PTEN genomic deletion defines favorable prognostic biomarkers in localized prostate cancer: a systematic review and meta-analysis. Int J ClinExp Med. 2015; 8:5430–5437. PMID: 26131120.

14. Krohn A., Diedler T., Burkhardt L., Mayer P., De Silva C. et al. Genomic deletion of PTEN is associated with tumor progression and early PSA recurrence in ERG fusion-positive and fusion-negative prostate cancer. Am J Pathol. 2012; 181:401–412. Doi: 10.1016/j.ajpath.2012.04.026.

15. Lotan T.L., Wei W., Ludkovski O., Morais C., Guedes L. et al. Analytic validation of a clinical-grade PTEN immunohistochemistry assay in prostate cancer by comparison with PTEN FISH.Mod Pathol. 2016; 29:904–914. Doi:10.1038/modpathol.2016.88.

16. Ahearn T.U., Pettersson A., Ebot E., Gerke T., Graff R. et al.A Prospective Investigation of PTEN Loss and ERG Expression in Lethal Prostate Cancer. J Natl Cancer Inst. 2016; 108 (2):djv346. Doi: 10.1093/jnci/djv346.

17. Reid A.H., Attard G., Ambroisine L., Fisher G., Kovacs G. et al. Molecular characterisation of ERG, ETV1 and PTEN gene loci identifies patients at low and high risk of death from prostate cancer. Br J Cancer.2010; 102:678–684. Doi: 10.1038/sj.bjc.6605554.

18. Mithal P., Allott E., Gerber L., Reid J., Welbourn W., et al. PTEN loss in biopsy tissue predicts poor clinical outcomes in prostate cancer. International journal of urology: official journal of the Japanese Urological Association. 2014; 21:1209–1214. Doi: 10.1111/iju.12571.

19. Loginova M.V., Pavlov V.N., Gilyazova I. R. Radiomics and radiogenomics of prostate cancer. Yakutmedicaljournal. 2021;1:101–104. Russian (Логинова М.В., Павлов В.Н., Гилязова И.Р. Радиомика и радиогеномика рака предстательной железы. Якутский медицинский журнал. 2021;1:101–104. Doi: 10.25789/YMJ.2021.73.27.

20. Wang C., Nie H., Li Y., Liu G., Wang X., Xing S., Zhang L., Chen X., Yand C. Y .L. The study of the relation ofDNArepair pathway genes SNPs and the sensitivity to radiotherapy and chemotherapy of NSCLC. Sci Rep. 2016; 6:26526. Doi: 10.1038/srep26526.

21. Zhu J., Wang M., He J., Zhu M., Wang J.C., Jin L., Wang X.F., Yang Y.J., Xiang J.Q., WeiQ. Polymorphisms in the AKT1 and AKT2 genes and oesophageal squamous cell carcinoma risk in an Eastern Chinese population. J Cell Mol Med. 2016; 20:666–677. Doi: 10.1111/jcmm.12750.

22. Jang Y., Lu S.A., Chen Z.P., Ma J., Xu C.Q., Zhang C.Z.,Wang J.J.Genetic polymorphisms of CCND1 and PTEN in progression of esophageal squamous carcinoma. Genet Mol Res. 2013;12:6685-6691.Doi: 10.4238/2013.

Об авторах / Для корреспонденции

А в т о р д л я с в я з и: М. В. Логинова – врач-онколог онкологического отделения противоопухолевой лекарственной терапии №2, ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Клиника БГМУ Минздрава России, Республика Башкортостан, Уфа, аспирант кафедры урологии с курсом ИДПО ФГБОУ ВО БГМУ, Уфа, Россия; e-mail: mariialoginova25@ gmail.com

Также по теме