Видовая струк- тура и молекулярно-генетическая характеристика антибио- тикорезистентных штаммов грамотрицательных микроорганизмов, выделенных от пациентов урологического отделения


DOI: https://dx.doi.org/10.18565/urology.2018.1.77-83

Б.У. Шалекенов, А.Л. Бисекенова, Б.А. Рамазанова, Д.А. Адамбеков, С.Б. Шалекенов

1 Казахский медицинский университет непрерывного образования, Алматы, Казахстан; 2 Казахский национальный медицинский университет им. С. Д. Асфендиярова, Алматы, Республика Казахстан; 3 Кыргызская государственная медицинская академия им. И. К. Ахунбаева, Бишкек, Кыргызская Республика
Цель: провести анализ структуры и молекулярных механизмов антибиотикорезистентности грамотрицательных бактерий – возбудителей инфекций мочевыводящих путей (ИМП) у взрослых пациентов Алматы.
Материалы и методы. Изучены этиологическая структура и антибиотикочувствительность клинически значимых изолятов бактерий и грибов (≥ 103), выделенных из мочи пациентов отделения урологии ЦГКБ № 12 Алматы. Продукцию β-лактамаз расширенного спектра действия (БЛРС) у антибиотикорезистентных штаммов определяли фенотипическим методом двойных дисков. Детекцию генов класса А для культур с подтвержденным БЛРС-фенотипом (TEM1, CTX-M1, SHV, OXA), генов карбапенемаз класса B металло-β-лактамаз (VIM-2) проводили методом ПЦР.
Результаты. Среди изолятов, полученных от пациентов, доля представителей семейства Enterobacteriaceae в этиологической структуре возбудителей ИМП составила 44,8%, в том числе E. coli была возбудителем в 31% случаев, K. pneumoniae – в 4,6%. Наибольшей активностью по отношению ко всем видам энтеробактерий обладали карбапенемы (96,3–100%). В отношении E. coli высокую активность проявляли нитрофурантоин (96,3%), амикацин (92,6%) и цефокситин (81,5%). Высокая частота резистентности к цефалоспоринам III–IV поколений E. coli (44,4%), K. pneumoniae (50%) была обусловлена продукцией БЛРС CTX-M1- и OXA-типов. Доля неферментирующих грамотрицательных бактерий в этиологической структуре возбудителей ИМП составила 3,5%. Среди них зарегистрирован штамм, продуцирующий металло-β-лактамазу (VIM-2), характеризующийся абсолютной резистентностью к антибиотикам всех классов, включая карбапенемы.
Заключение. Полученные данные по профилям чувствительности и молекулярно-генетическим механизмам резистентности грамотрицательных уропатогенов уникальны для региона (Алматы), позволяют разработать тактику рациональной антибиотикотерапии. Своевременная микробиологическая диагностика и строгое соблюдение мер инфекционного контроля в конкретном стационаре – единственный путь сдерживания распространения БЛРС, МБЛ.
Ключевые слова: инфекции мочевыводящих путей, грамотрицательные микроорганизмы, Enterobacteriaceae, антибиотикорезистентность, β-лактамазы расширенного спектра, металло-β-лактамазы

Литература


1. Palagin I.S., Sukhorukova M.V., Dekhnich A.V., Eidel’shtein M.V., Shevelev A.N., Grinev A.V., Perepanova T.S., Kozlov R.S., DARMIS study group. The current state of antibiotic resistance of causative agents of community-acquired infections of the urinary tract in Russia: the results of the DARMIS study (2010–2011). Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2012;14(4):280–301. Russian (Палагин И.С., Сухорукова М. В., Дехнич А.В., Эйдельштейн М. В., Шевелев А. Н., Гринев А.В., Перепанова Т.С., Козлов Р.С., исследовательская группа «ДАРМИС». Современное состояние антибиотикорезистентности возбудителей внебольничных инфекций мочевых путей в России: результаты исследования «ДАРМИС» (2010–2011). Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2012;14(4):280–301).

2. Hooton T.M. Uncomplicated urinary tract infection. New Engl J Med. 2012;366:1028–1037.

3. Kahlmeter G., ECO.SENS. An international survey on the antimicrobial susceptibility of pathogens from uncomplicated urinary tract infections: the ECO.SENS Project. J Antimicrob Chemother. 2003;51:69–76.

4. Nicole L. Epidemiology of urinary tract infections. Infect Med. 2001;18:153–162.

5. Foxman B. Epidemiology of urinary tract infetions: incidence, morbility and economic cost. Am J Med. 2002;113:5–13.

6. Kosyakova K.G., Kameneva O.A., Morozova S.E. The etiological structure and antibiotic resistance of pathogens of community-acquired infections of the urinary system. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2015;17(2)1:33. Russian (Косякова К.Г., Каменева О.А., Морозова С.Е. Этиологическая структура и антибиотикорезистентность возбудителей внебольничных инфекций мочевой системы. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2015;17(2)1:33).

7. Palagin I.S., Sukhorukova M.V., Dekhnich A.V., Eidel’shtein M.V., Grinev A.V., Perepanova T.S., Kozlov R.S., DARMIS study group. Complicated out-of-hospital infections of the urinary tract in adult patients in Russia. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2014;16(1):39–56. Russian (Палагин И.С., Сухорукова М.В., Дехнич А.В., Эйдельштейн М.В., Гринев А.В., Перепанова Т.С., Козлов Р.С., исследовательская группа «ДАРМИС». Осложненные внебольничные инфекции мочевых путей у взрослых пациентов в России. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2014;16(1):39–56).

8. Sidorenko S.V., Berezin A.G., Ivanov D.V. Molecular mechanisms of resistance of gram-negative bacteria of the Enterobacteriaceae family to cephalosporin antibiotics. Antibiotiki i khimioterapiya. 2011;49(3):6–16. Russian (Сидоренко С.В., Березин А.Г., Иванов Д.В. Молекулярные механизмы устойчивости грамотрицательных бактерий семейства Enterobacteriaceae к цефалоспориновым антибиотикам. Антибиотики и химиотерапия. 2011;49(3):6–16).

9. Il’ina V.N., Subbotovskaya A.I., Kozyreva V.S., Sergeevichev D.S., Shilova A.N. Characteristics of Enterobacteriaceae strains producing CTX­M type ESBL, isolated in a cardiac surgery hospital. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2013; 15(4):309–314. Russian (Ильина В.Н., Субботовская А.И., Козырева В.С., Сергеевичев Д.С., Шилова А.Н. Характеристика штаммов Enterobacteriaceae, продуцирующих БЛРС CTX-M типа, выделенных в кардиохирургическом стационаре. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2013; 15(4):309–314).

10. Breidenstein E.B., delaFuente-Nunez C., Hancock R.E. Pseudomonas aeruginosa: all roads lead to resistance. Trends Microbiol. 2011;19(8):419–426.

11. Eidel’shtein M.V., Skleenova E.Yu., Shevchenko O.V. et al. The prevalence and molecular epidemiology of Gram-negative bacteria producing metal-beta-lactamase in Russia, Belarus and Kazakhstan. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya.2012;14(2):132–152. Russian (Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Шевченко О.В. и др. Распространенность и молекулярная эпидемиология грамотрицательных бактерий, продуцирующих металло-бета-лактамазы, в России, Беларуси и Казахстане. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия.2012;14(2):132–152).

12. Pfeifer Y., Cullik A., Witte W. Resistance to cephalosporins and carbapenems in Gram-negative bacterial pathogens. Int J Med Microbiol. 2010;300(6):371–379.

13. Eidel’shtein M.V., Sukhorukova M.V., Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V. et al. Antibiotic resistance of nosocomial strains of Pseudomonas aeruginosa in Russian hospitals: results of a multicentre epidemiological study MARATHON 2013–2014. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2017; 19(1): 37–41. Russian (Эйдельштейн М.В., Сухорукова М.В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Pseudomonas aeruginosa в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013–2014. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2017; 19(1): 37–41).

14. Sukhorukova M.V., Eidel’shtein M. V., Skleenova E.Yu., Ivanchik N.V. et al. Antibiotic resistance of nosocomial strains of Enterobacteriaceae in Russian hospitals: results of a multicentre epidemiological study MARATHON 2013–2014. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2017; 19(1):49–56. Russian (Сухорукова М.В., Эйдельштейн М. В., Склеенова Е.Ю., Иванчик Н.В. и др. Антибиотикорезистентность нозокомиальных штаммов Enterobacteriaceae в стационарах России: результаты многоцентрового эпидемиологического исследования «МАРАФОН» 2013–2014. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2017; 19(1):49–56).

15. Ghafourian S. et al. Incidence of extended-spectrum beta-lactamase-producing Klebsiellapneumniae in patients with urinary tract infection. Sao Paulo Med. J. 2012;130(1):37–43.

16. Eidel’shtein M.V., Skleenova E.Yu., Shevchenko O.V., Tapal’skii D.V., Azizov I.S., Dsouza D.V., Timokhova A.V., Sukhorukova M.V., Kozyreva V.K., Safronova E.V., Astakhova M.V., Karpov I.A., Shamaeva S.Kh., Abramova N.V., Gordinskaya N.A., Kozlov R.S. Prevalence and molecular epidemiology of gram-negative bacteria producing metal-beta-lactamases in Russia, Belarus and Kazakhstan. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2012;14(2):132–152. Russian (Эйдельштейн М.В., Склеенова Е.Ю., Шевченко О.В., Тапальский Д.В., Азизов И.С., Дсоуза Д.В., Тимохова А.В., Сухорукова М.В., Козырева В.К., Сафронова Е.В., Астахова М.В., Карпов И.А., Шамаева С.Х., Абрамова Н.В., Гординская Н.А., Козлов Р.С. Распространенность и молекулярная эпидемиология грамотрицательных бактерий, продуцирующих метало-бета-лактамазы, в России, Беларуси и Казахстане. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2012;14(2):132–152).

17. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint Tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 4.0, 2014 (http://www.eucast.org).

18. Eidel’shtein M.V. Detection of extended-spectrum beta-lactamases in Gram-negative bacteria using phenotypic methods. Klinicheskaya mikrobiologiya antimikrobnaya khimioterapiya. 2001;3(2):183–189. Russian (Эйдельштейн М.В. Выявление бета-лактамаз расширенного спектра у грамотрицательных бактерий с помощью фенотипических методов. Клиническая микробиология антимикробная химиотерапия. 2001;3(2):183–189).

19. Monstein H.J., Ostholm-Balkhed A., Nilsson M.V., Nilsson M., Dornbusch K., Nilsson L.E. Multiplex PCR amplification assay for the detection of blaSHV, blaTEM and blaCTX-M genes in Enterobacteriaceae. APMIS 2007;115:1400–1408.


Об авторах / Для корреспонденции


А в т о р д л я с в я з и: А. Л. Бисекенова – к.м.н., доцент кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии КазНМУ им. С. Д. Асфендиярова, Алматы, Республика Казахстан; e-mail: bissekenova_akma@mail.ru


Бионика Медиа