English
Микробиом уретры у мужчин, больных туберкулезом легких
DOI: https://dx.doi.org/10.18565/urology.2021.6.66-71
А.Г. Чередниченко, Е.В. Кульчавеня, Л.С. Евдокимова, Д.П. Холтобин
1) ФГБУ «Новосибирский НИИ туберкулеза» Минздрава России, Новосибирск, Россия; 2) ГБОУ ВПО «Новосибирский государственный медицинский университет» Минздрава России, Новосибирск, Россия, 3) Медицинский центр «Авиценна», Новосибирск, Россия
Цель исследования: определить влияние длительной многокомпонентной антибактериальной терапии на микробиом уретры мужчин.
Материал и методы. Проведено открытое проспективное несравнительное исследование, в которое были включены 75 мужчин, из них 63 больных туберкулезом органов дыхания, получавших противотуберкулезную терапию в течение не менее 3 и не более 5 мес., без инфекционно-воспалительных урологических заболеваний (основная группа), 12 – пациенты с неинфекционными урологическими заболеваниями (мочекаменная болезнь, аденома простаты), с нормальными анализами мочи (группа сравнения). Всем больным проводили соскоб уретры стерильным тампоном после туалета наружных половых органов. Идентификацию патогенных микроорганизмов и количественную оценку видового состава микробиоты в полученных образцах биоматериала проводили методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ). Количественные результаты исследования представлены в числе геномномного эквивалента в 1 мл (ГЭ/мл), значения которых пропорциональны микробной обсемененности урогенитального биотопа.
Результаты исследования. «Классическая» патогенная микрофлора в соскобе уретры выявлена у каждого третьего-четвертого больного туберкулезом. Enterobacteriaceae spp./Enterococcus spp. в титре 103–104 ГЭ/мл идентифицирована у 16 (25,4%) пациентов, Staphylococcus spp. в титре 103–106 ГЭ/мл у 20 (31,7%). В группе сравнения у лиц, не принимавших антибактериальных препаратов, Staphylococcus spp. присутствовал в половине случаев (6 [50%] пациентов), Enterobacteriaceae spp./Enterococcus spp. – у каждого третьего (4 [33,3%] пациента) в титре 103–105 ГЭ/мл. У больных туберкулезом наиболее часто обнаруживали Corynebacterium spp. (31 [49,2%] случай), в то время как в группе сравнения этот микроорганизм был выявлен у 3 (25,0%) пациентов. В то же время частота обнаружения Candida spp. в соскобе уретры в основной группе и в группе сравнения не различалась (соответственно 7,9 и 8,3%).
Выводы. Больные туберкулезом, получающие полихимиотерапию в течение минимум 3 мес., и лица без признаков инфекционно-воспалительного процесса в мочевыводящих путях имеют статистически значимые различия в спектре микрофлоры уретры.
Литература
1. Global tuberculosis report 2020; доступен на https://www.who.int/publications/i/item/9789240013131 2. Shcherban M.N., Kulchavenya E.V., Brizhatyuk E.V. Diagnostics, prevention and treatment of reproductive disorders in men with pulmonary tuberculosis. Tuberculosis and lung diseases. 2010;10:31–36. Russian (Щербань М.Н., Кульчавеня Е.В., Брижатюк Е.В. Диагностика, предупреждение и лечение нарушений репродуктивной функции у мужчин, больных туберкулёзом легких. Туберкулез и болезни легких. 2010;10:31–36). 3. Kulchavenya E.V., Zhukova II Extrapulmonary tuberculosis – there are more questions than answers. Tuberculosis and lung diseases. 2017;95(2):59–63. Doi: 10.21292/2075-1230-2017-95-2-59-63. Russian (Кульчавеня Е.В., Жукова И.И. Внелегочный туберкулез – вопросов больше, чем ответов. Туберкулёз и болезни лёгких. 2017;95(2):59–63. Doi: 10.21292/2075-1230-2017-95-2-59-63). 4. Kulchavenya E., Naber K., Bjerklund Johansen T.E. Urogenital tuberculosis: classification, diagnosis, and treatment. Eur. Urol. Suppl. 2016;15(4):112–121. 5. Biswas K., Wagner Mackenzie B., Ballauf C., Draf J., Douglas R.G., Hummel T. Loss of bacterial diversity in the sinuses is associated with lower smell discrimination scores. Sci Rep. 2020;10(1):16422. Doi: 10.1038/s41598-020-73396-3. 6. Neugent M.L., Hulyalkar N.V., Nguyen V.H., Zimmern P.E., De Nisco N.J. Advances in Understanding the Human Urinary Microbiome and Its Potential Role in Urinary Tract Infection. mBio. 2020;11(2):e00218–20. Doi: 10.1128/mBio.00218-20. 7. Siddiqui H., Nederbragt A.J., Lagesen K., Jeansson S.L., Jakobsen K.S. Assessing diversity of the female urine microbiota by high throughput sequencing of 16S rDNA amplicons. BMC Microbiol. 2011;11:244. Doi:10.1186/1471-2180-11-244. 8. Wolfe A.J., Toh E., Shibata N., Rong R., Kenton K., Fitzgerald M., Mueller E.R., Schreckenberger P., Dong Q., Nelson D.E., Brubaker L. Evidence of uncultivated bacteria in the adult female bladder. J Clin Microbiol. 2012;50:1376–1383. Doi:10.1128/JCM.05852-11. 9. Kogan M.I., Naboka Yu.L., Ibishev Kh.S., Gudima I.A. Non-sterility of the urine of a healthy person is a new paradigm in medicine. Urology. 2014;5:48–52. Russian (Коган М.И., Набока Ю.Л., Ибишев Х.С., Гудима И.А. Нестерильность мочи здорового человека – новая парадигма в медицине. Урология.2014;5:48–52). 10. Hilt E.E., McKinley K., Pearce M.M., Rosenfeld A.B., Zilliox M.J., Mueller E.R., Brubaker L., Gai X., Wolfe A.J., Schreckenberger P.C. Urine is not sterile: use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder. J Clin Microbiol. 2014;52:871–876. Doi:10.1128/JCM.02876-13. 11. Brubaker L., Wolfe A.J. The female urinary microbiota, urinary health and common urinary disorders. Ann Transl Med. 2017;5:34. Doi:10.21037/atm.2016.11.62. 12. Lloyd-Price J., Abu-Ali G., Huttenhower C. The healthy human microbiome. Genome Med 2016;8:51. Doi:10.1186/s13073-016-0307-y. 13. Postler T.S., Ghosh S. Understanding the holobiont: how microbial metabolites affect human health and shape the immune system. Cell Metab 2017;26:110–130. Doi:10.1016/j.cmet.2017.05.008. 14. Naboka Yu.L., Kogan M.I., Gudima I.A., Mitusova E.V., Dzhalagoniya K.T., Ivanov S.N. Is there a relationship between urine, vaginal and gut microbiota in upper urinary tract infections? Urology Bulletin. 2019; 7 (1): 38–45. Doi: 10.21886 / 2308-6424-2019-7-1-38-45. (in Russian). Набока Ю.Л., Коган М.И., Гудима И.А., Митусова Е.В., Джалагония К.Т., Иванов С.Н. Существует ли взаимосвязь между микробиотой мочи, влагалища и кишечника при инфекции верхних мочевых путей? Вестник урологии. 2019;7(1):38–45. Doi: 10.21886/2308-6424-2019-7-1-38-45. 15. Gritz E.C., Bhandari V. The human neonatal gut microbiome: a brief review. Front Pediatr 2015;3:17. Doi:10.3389/fped.2015.00017. 16. Shannon M.B., Limeira R., Johansen D., Gao X., Lin H., Dong Q., Wolfe A.J., Mueller E.R. Bladder urinary oxygen tension is correlated with urinary microbiota composition. Int Urogynecol J 2019;30:1261–1267. Doi:10.1007/s00192-019-03931-y. 17. Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature 2012;486:207–214. Doi:10.1038/nature11234. 18. Turnbaugh P.J., Ley R.E., Hamady M., Fraser-Liggett C.M., Knight R., Gordon J.I. The Human Microbiome Project. Nature 2007;449:804–810. Doi:10.1038/nature06244. 19. Gilbert J.A., Blaser M.J., Caporaso J.G., Jansson J.K., Lynch S.V., Knight R. Current understanding of the human microbiome. Nat Med 2018;24:392–400. Doi:10.1038/nm.4517. 20. Lloyd-Price J., Mahurkar A., Rahnavard G., Crabtree J., Orvis J., Hall A.B., Brady A., Creasy H.H., McCracken C., Giglio M.G., McDonald D., Franzosa E.A., Knight R., White O., Huttenhower C. Strains, functions and dynamics in the expanded Human Microbiome Project. Nature 2017;550:61–66. Doi:10.1038/nature23889. 21. Meštrović T., Matijašić M., Perić M., Čipčić Paljetak H., Barešić A., Verbanac D.. The Role of Gut, Vaginal, and Urinary Microbiome in Urinary Tract Infections: From Bench to Bedside. Diagnostics (Basel). 2020;11(1):7. Doi: 10.3390/diagnostics11010007. 22. Gasiorek M., Hsieh M.H., Forster C.S. Utility of DNA Next-Generation Sequencing and Expanded Quantitative Urine Culture in Diagnosis and Management of Chronic or Persistent Lower Urinary Tract Symptoms. J. Clin. Microbiol. 2019;58:e00204–219. Doi: 10.1128/JCM.00204-19. 23. Wagenlehner F.M., Weidner W., Pilatz A., Naber K.G. Urinary tract infections and bacterial prostatitis in men. Curr. Opin. Infect. Dis. 2014;27:97–101. Doi: 10.1097/QCO.0000000000000024. 24. Mores C.R., Price T.K., Wolff B., Halverson T., Limeira R., Brubaker L., Mueller E.R., Putonti C., Wolfe A.J. Genomic relatedness and clinical significance of Streptococcus mitis strains isolated from the urogenital tract of sexual partners. Microb Genom. 2021 Mar;7(3). Doi: 10.1099/mgen.0.000535. 25. Goldstein E.J., Citron D.M., Vreni Merriam C., Warren Y., Tyrrell K.L. Comparative in vitro activities of ertapenem (MK-0826) against 1,001 anaerobes isolated from human intra-abdominal infections. Antimicrob Agents Chemother. 2000;44(9):2389–2394. Doi:10.1128/AAC.44.9.2389–2394.2000 26. Tan T.Y., Ng L.S., Kwang L.L., Rao S., Eng L.C. Clinical characteristics and antimicrobial susceptibilities of anaerobic bacteremia in an acute care hospital. Anaerobe. 2017;43:69–74. Doi:10.1016/j.anaerobe.2016.11.009. 27. Yunoki T., Matsumura Y., Yamamoto M., et al. Genetic identification and antimicrobial susceptibility of clinically isolated anaerobic bacteria: a prospective multicenter surveillance study in Japan. Anaerobe. 2017;48:215–223. Doi:10.1016/j.anaerobe.2017.09.003 28. Wang Y., Han Y., Shen H., Lv Y., Zheng W., Wang J. Higher Prevalence of Multi-Antimicrobial Resistant Bacteroides spp. Strains Isolated at a Tertiary Teaching Hospital in China. Infect Drug Resist. 2020;13:1537–1546. Doi: 10.2147/IDR.S246318 29. Nagasawa R., Hara Y., Miyazaki T., Murohashi K., Watanabe H., Kaneko T.. An autopsy case of ventilator-associated tracheobronchitis caused by Corynebacterium species complicated with diffuse alveolar damage. Respir Med Case Rep. 2020;31:101208. Doi: 10.1016/j.rmcr.2020.101208. 30. Nicolosi D, Genovese C, Cutuli MA, D’Angeli F, Pietrangelo L, Davinelli S, Petronio Petronio G, Di Marco R. Preliminary in Vitro Studies on Corynebacterium urealyticum Pathogenetic Mechanisms, a Possible Candidate for Chronic Idiopathic Prostatitis? Microorganisms. 2020 Mar 25;8(4):463. Doi: 10.3390/microorganisms8040463. 31. Laurent O.B., Sinyakova L.A., Vinarova N.A., Nikiforov N.V. Persistent dysuria in women. Topical issues of diagnosis and treatment. Urologiia. 2013;2:5–8. Russian (Лоран О.Б., Синякова Л.А., Винарова Н.А., Никифоров Н.В. Стойкая дизурия у женщин. Актуальные вопросы диагностики и лечения. Урология.2013;2:5–8). 32. Chauvelot P, Ferry T, Tafani V, Diot A, Tasse J, Conrad A, Chidiac C, Braun E, Lustig S, Laurent F, Valour F. Bone and Joint Infection Involving Corynebacterium spp.: From Clinical Features to Pathophysiological Pathways. Front Med (Lausanne). 2021;7:539501. Doi: 10.3389/fmed.2020.539501. 33. Brassil B., Mores C.R., Wolfe A.J., Putonti C. Characterization and spontaneous induction of urinary tract Streptococcus anginosus prophages. J Gen Virol. 2020;101(6):685–691.Doi: 10.1099/jgv.0.001407.
Об авторах / Для корреспонденции
А в т о р д л я с в я з и: Е. В. Кульчавеня – д.м.н., профессор, главный научный сотрудник ФГБУ ННИИТ МЗ РФ, руководитель отдела урологии, профессор кафедры туберкулеза НГМУ, Новосибирск, Россия; e-mail: urotub@yandex.ru
Похожие статьи
